phymlp简介

快速开始指南

本指南将帮助您快速掌握 PhyMLP Kit 的核心功能，从自动训练集生成到机器学习势函数训练与验证的完整流程。我们将按照以下步骤进行：

1. 配置文件说明

2. 自动训练集生成流程

3. 机器学习势函数训练

4. 性质计算与验证

• 快速开始指南
• 概述
• 安装与设置
  • 1. 环境要求
  • 2. 安装 PhyMLP Kit
  • 3. 配置软件路径
• 基本使用
• 核心功能模块
  • 1. 机器学习势训练
  • 2. 初始势函数生成
  • 3. 数据格式转换
    • 3.1 OUTCAR 转 Extxyz
    • 3.2 CFG 转 Extxyz
    • 3.3 Dump 转 POSCAR
  • 4. 数据集处理
    • 4.1 数据集分割
    • 4.2 KPATH 生成
  • 5. 自动训练集生成流程
    • 5.1 从 Materials Project 获取结构
    • 5.2 生成形变结构
    • 5.3 生成微扰结构
    • 5.4 设置 VASP 计算
    • 5.5 提交 VASP 计算
  • 6. 数据分析与拟合
    • 6.1 处理形变计算结果
    • 6.2 Birch-Murnaghan 状态方程拟合
    • 6.3 实验 P-V 数据拟合
  • 7. 数据集生成
    • 7.1 生成 Extxyz 数据集
    • 7.2 测试 POTCAR 生成
  • 8. 完整工作流
• 典型工作流程示例
  • 1. 准备阶段
  • 2. 训练阶段
  • 3. 扩展训练集（可选）
  • 4. 验证阶段
• 配置说明
  • 1. 主配置文件（input.yaml）
  • 2. 训练配置文件（Inputfile）
• 常见问题
  • 1. 软件路径错误
  • 2. 训练失败
  • 3. VASP 计算设置错误
  • 4. 数据集生成问题
• 高级功能
  • 1. 批量处理
  • 2. 自定义工作流
  • 3. 并行计算
• 获取帮助
• 下一步

配置文件说明

PhyMLP Kit 使用两个主要配置文件：input.yaml 用于控制自动训练集生成，Inputfile.txt 用于控制训练和性质计算。

自动采样配置参数

这是自动化获取训练集的的配置文件，在案例中以input.yaml文件呈现：

• 自动化获取训练集配置文件
• 概述
  • 文件结构概览
• 详细参数说明
  • 1. Materials Project API 配置
  • 2. 元素配置
  • 3. 输出路径配置
  • 4. 用户自定义 POSCAR 配置
  • 5. 形变参数配置
  • 6. 微扰参数配置
  • 7. 经验势函数结构转换配置
  • 8. VASP 计算配置
    • 8.1 VASP 任务设置
    • 8.2 VASP 参数配置
  • 9. Birch-Murnaghan 拟合配置
  • 10. 实验 P-V 数据拟合配置
  • 11. Extxyz 数据集生成配置
• 使用示例
• 注意事项
• 相关文档

自动训练及检验配置

这是机器学习势函数自动化训练和检验的配置文件，在案例中以inputfile文件呈现：

• 训练和检验配置文件
• 概述
  • 文件结构概览
• 详细参数说明
  • 1. 必须自定义的参数
    • 1.1 软件路径设置
  • 2. 训练过程参数设置（可选自定义）
    • 2.1 基本训练控制
    • 2.2 输出说明
  • 3. 性质计算参数设置（可选自定义）
    • 3.1 基本计算控制
    • 3.2 物性计算选项
    • 3.3 单位系统
• 配置示例
• 使用流程
• 常见问题
• 相关文档
• 版本说明